Nõukogu
Eesti Haigekassa kõrgeim organ on Nõukogu. Selle koosseisu täpsustab Eesti Haigekassa seadus. Täpne loetelu nõukogu pädevusest ja ülesannetest on toodud Eesti Haigekassa seaduse §12.
Riigi huvide esindajad
- Sotsiaalminister- Tanel Kiik
- Rahandusminister- Martin Helme
Kindlustatute huvide esindajad
- Eesti Puuetega Inimeste Koja juhatuse liige- Ulvi Tammer-Jäätes
- Eesti Ametiühingute Keskliidu liige- Jüri Lember
Tööandjate huvide esindajad
- Eesti Tööandjate Keskliidu juhataja - Arto Aas
- Priit Perens