В 2001 году была создана публично-правовая Больничная касса Эстонии, которая организует здравоохранение, чтобы гарантировать застрахованным лицам компенсации здравоохранения. Задачей Больничной кассы Эстонии и её региональных отделений является содействие при составлении лечебных стандартов и лечебных правил, мотивация лечебных учреждений развивать качество услуг здравоохранения. Кроме этого, задачей больничной кассы является организация здравоохранения и выполнения внешних договоров, затрагивающих больничную кассу; участие в планировании здравоохранения; выражение мнения о связанных с больничной кассой и медицинским страхованием проектах правовых актов и внешних договоров и давать советы по связанным с медицинским страхованием вопросам.

Целью медицинского страхования Эстонии является покрытие расходов здравоохранения на лечение и профилактику болезней застрахованных лиц, финансирование приобретения лекарств и медицинских устройств и выплата компенсаций по временной нетрудоспособности и других денежных компенсаций.

Здравоохранение Эстонии следует принципу солидарности: при заболевании стоимость оплачиваемой больничной кассой услуги здравоохранения не зависит от того, сколько социального налога уплачено за конкретного человека. Из уплаченного за работающих людей социального налога больничная касса оплачивает также услуги здравоохранения, оказанные тем людям, которые в настоящее время не работают.

Цели, задачи, основы компетенции и деятельности Больничной кассы Эстонии и её органы определяет Закон о Больничной кассе Эстонии.

Высшим органом Больничной кассы Эстонии является состоящий из 15 членов совет, 5 из которых представляют интересы работодателей, 5 – интересы застрахованных и 5 – интересы государства. Возглавляет Больничную кассу Эстонии правление, председателем которого является Ханнес Данилов. Региональными отделениями больничной кассы руководят директоры.

Миссия: миссия Больничной кассы Эстонии – гарантировать людям доступность компенсаций медицинского страхования и способность дальнейшего фунционирования системы здравоохранения.

Видение: видение Больничной кассы Эстонии – гарантировать людям чувство защищённости при возникновении и решении возможных проблем со здоровьем.

Основные ценности:

Прогрессивность – наша деятельность направлена на постоянное и способное функционировать развитие, предпосылкой которого являются компетентные, лояльные, посвящённые результату работники.
Тщательность – мы надёжны, открыты и доброжелательны. Принимаем решения с учётом мнения других и прозрачно.
Сотрудничество – создаём лояльную атмосферу внутри организации и при общении с партнёрами и клиентами.